主人公冈本弘树收到一段视频，视频中他心爱的妹妹由里被名为EDEN（与前作中的组织不同）的组织绑架并强奸，该组织由筱原领导。在拼命营救妹妹的过程中，他发现由里的朋友咲香织也成为了与EDEN有关联的人的目标。